I de seneste år har kommunerne været i gang med at adskille myndigheds- og driftsopgaver og har udskilt de enkelte driftsområder i særskilte selskaber. På affaldsområdet er dette dog endnu ikke gennemført i alle kommuner. COWI kan hjælpe med planlægningen og organiseringen.

Sammenlægning eller fusionering af selskaber COWI har blandt andet udarbejdet analyser af fordele og ulemper ved sammenlægning af selskaber ud fra en sammenligning af infrastruktur, organisation og økonomi kombineret med de enkelte selskabers strategier for fremtidig udvikling.

Interessentanalyser
COWI udarbejder også interessentanalyser for affaldssektoren, f.eks. i forbindelse med mulig organisering af affaldssektoren.